ＤＮＡレベルの比較による真骨魚類の多様性と類縁関係

　水産研究所では魚介類など水産生物を，いかに減らさないようにうまく獲るか（資源管理），うまく増やすか（栽培漁業）という研究を行っている．そのためにはそもそも対象とする生物の性質を知る必要がある．水産生物といえばメインはやはり魚であろう．では魚とはどんな生き物なのだろう．

　魚類は，約50,000種といわれる脊椎動物のうちのおよそ半分をしめるグループである．中でも，ヤツメウナギなどの円口類とサメやエイなどの軟骨魚類それぞれ数百〜1,000種程度をのぞくと，その大半は硬骨魚類であり，さらに，肺魚やシーラカンスといった「生きた化石」のような，せいぜい数１０種しかないいくつかのグループをのぞくと，その大半は真骨魚類というグループからなる．真骨魚類は代表的な進化的硬骨魚で，堅く発達した骨格，なめらかな鱗，うちわ状の均整のとれた尾びれなど，水中生活にとくに適応した体制を持っている．
　真骨魚類は25,000種以上からなる，地球上で最大の脊椎動物のグループである．ヒマラヤの氷河から流れ出す小さな川から，数千mの深海，南極の氷の下から，熱帯のジャングルを流れる川まで，あらゆる水環境に進出している．種の数を繁栄のバロメータとすると，地球上でもっとも繁栄している脊椎動物は真骨魚類である．この点では我々人類の属するほ乳類（約5,000種といわれる）など問題にならない．
　真骨魚類はいうまでもなく我々人類と経済的・産業的に密接な関わりを持つグループである．たとえば，寿司ネタに真骨魚でない魚はない．そもそも我々が普段，魚といえば思い浮かべるもの，タイ・ヒラメ・フグ・サバ・カツオ・キチヂ・ボラ・タラ・メダカ・サンマ・サケ・アユ・コイ・イワシ・ウナギなどなど，これらはすべて真骨魚である．これらの生物多様性や類縁関係を明らかにすることは，その生理的・生態的な性質を進化の物差しで知ることである．こうした観点から，いかに減らさずうまく獲るか，うまく増やすかということについてのヒントが得られる．
　真骨魚類の生物多様性や類縁関係を明らかにすることはまた，同じぐらいの進化の歴史を持つほ乳類の来歴を考えるうえで有益な情報をもたらすに違いない．これはひいては「人はなぜいるのか」，あるいは「人はどこから来たのか」といった生物学の根本問題にかかわってくる．近年になって脅威的な勢いで発展してきた分子生物学的手法による，遺伝子の本体ＤＮＡの研究は，このようなテーマにもっとも適した，有効なやり方である．
　そこで，真骨魚の進化史を概観するために，ヒラメのミトコンドリアＤＮＡの構造解析(1)，(2)，や，ミトコンドリアＤＮＡ全長配列解析技術を応用した真骨魚の目レベル以上の上位分類群間の類縁関係の解析(3)，(4)を行った．

水産資源の遺伝的多様性とその保全