- 森田健太郎 (2003) 第4章. 卵サイズの多様性 「水産動物の性と行動生態」(中園明信編),恒星社厚生閣,東京.pp.48-65.
- 山本祥一郎・森田健太郎 (2003) 第8章. 人為的生息地隔離の魚類への影響 「水産動物の性と行動生態」(中園明信編),恒星社厚生閣,東京.pp.114-124.
- 森田健太郎・山本祥一郎 (2004) 第7章-2. ダム構築による河川分断化がもたらすもの-川は森と海をつなぐ道- 「サケ・マスの生態と進化」(前川光司編), 文一総合出版,東京.pp.281-312.
- 松田裕之・森田健太郎 (2004) 第9章. 生物の環境リスク, 第10章. ダムは壊すべきか「演習 環境リスクを計算する」(中西準子・益永茂樹・松田裕之編),岩波書店,東京.pp.159-184.
- 森田健太郎 (2005) 書評 本当に求められる河川計画を考える.岩波科学 75: 1108-1109.
- 森田健太郎・山本祥一郎・永沢亨 (2009) 北海道の抱卵ヤマメについて.SALMON情報 3: 8-10.
- 森田健太郎 (2009) 北光丸によるベーリング海のサケ資源調査.北の海から 第6号.
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